206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2823 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  74.56 
 
 		 291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  60.49 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  61.6 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  60.75 
 
 		 289 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  57.5 
 
 		 288 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  51.03 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  48.96 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  41.05 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  43.64 
 
 		 310 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  37.46 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.76 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  31.84 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  32.23 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.75 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.4 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 313 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.66 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.58 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.48 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.85 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25.23 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.85 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.22 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  23.01 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  23.01 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.54 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.3 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.96 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.19 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.41 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>