139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2289 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  662    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.93 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.75 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.32 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.75 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  24.5 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  21.94 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.92 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.51 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  22.86 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  24.4 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  24.07 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.05 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  26.75 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  22.93 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  24.83 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.11 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  22.42 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  21.58 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  24.31 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  27.04 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  21.89 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  22.84 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  22.84 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  20.61 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.04 
 
 		 644 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  24.39 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 477 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  21.23 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  22.17 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  23.27 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.2 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  22.57 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  23.46 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.32 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.18 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  22.44 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  20 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  20.96 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  26.25 
 
 		 637 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.68 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  21.8 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 479 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  22.95 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  21.81 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.68 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.62 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  19.85 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  24.61 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  24.42 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  20.82 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  22.02 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>