108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1898 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  95.24 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  64.51 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.83 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  26.56 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  27.04 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  25.81 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.46 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  24.67 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  24.19 
 
 		 318 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  23.92 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  23.21 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  22.01 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  20.91 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  22.99 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  21.89 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  20.9 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  22.64 
 
 		 339 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 347 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 597 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  20.72 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  21.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  21.08 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  25.66 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 657 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  22.16 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 656 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  25.13 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  21.89 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  21.61 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  26.51 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.37 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  23.08 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  23.56 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.89 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 677 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.04 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.47 
 
 		 390 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 		 655 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  20.77 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 337 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 304 aa  45.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 653 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.45 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  22.4 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  22.57 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.99 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 670 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  19.66 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  34.94 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  25.66 
 
 		 662 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 675 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 488 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  18.78 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  26.55 
 
 		 660 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  21.48 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  22.54 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  21.39 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  30 
 
 		 645 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  21.25 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 607 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.76 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 657 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>