222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2384 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  67.18 
 
 		 289 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  61.6 
 
 		 287 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 		 292 aa  358  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  60.97 
 
 		 291 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  58.66 
 
 		 288 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  52.16 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  48.79 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  40.74 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.79 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  34.02 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  32.36 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  33.2 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  30.56 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  34.41 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.78 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.69 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.66 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.32 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.44 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.22 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.86 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.51 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.63 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.84 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.36 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.85 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.16 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  22.79 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.88 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.59 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.43 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  21.29 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.43 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.22 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.11 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.1 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  22 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>