259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3742 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  100 
 
 		 318 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  47.94 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  47.94 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  45.37 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  45.39 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  32.13 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  37.3 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  30.07 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.87 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 		 294 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  31.27 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.18 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  32.1 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  29.09 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.73 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.27 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.37 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.5 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.55 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  21.86 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  26.58 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  26.57 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  23.16 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  22.62 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.61 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.17 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.27 
 
 		 637 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  23.33 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.65 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 210 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  21.6 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  22.92 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  22.92 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>