184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1562 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  51.39 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  52.99 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  51.68 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  49.58 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  47.9 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  45.41 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  46.09 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  45.76 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  44.26 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  26.99 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  23.76 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  23.29 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  22.96 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  22.71 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  21.14 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  22.71 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  25.56 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  21.14 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  21.89 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  24.16 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  22.31 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  25.96 
 
 		 353 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.36 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  22.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  24.78 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  21.15 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  24.1 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 322 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  21.97 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.55 
 
 		 348 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  28.72 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  21.76 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  27.92 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.56 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  24.37 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  23.68 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  28.68 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  24.36 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  20.69 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  25.88 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  26.01 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  21.66 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 310 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  21.66 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>