110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00137 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 260 aa  540  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  47.39 
 
 		 251 aa  244  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  46.56 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  45.45 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  45.73 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  44.26 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  46.35 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  46.81 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  44.26 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 307 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  26.63 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  23.83 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.79 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.66 
 
 		 348 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  25.29 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 324 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  23.96 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  28.41 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  23.91 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 363 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 332 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.06 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  21.52 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 346 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  36.54 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 		 364 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  23.4 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  27.88 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.75 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  25.61 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  23.5 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  24.18 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  24.73 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  31.9 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  25.11 
 
 		 331 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  22.82 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  27.69 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  22.02 
 
 		 317 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  24.22 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  26.42 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  35.71 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  22.48 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  28.4 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  24.42 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>