More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0019 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  69.08 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  45.85 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 		 321 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 322 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 296 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 295 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 322 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  32.08 
 
 		 277 aa  89  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 285 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 		 285 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 285 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 281 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 275 aa  88.2  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 281 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  31.4 
 
 		 285 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 		 285 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 402 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 299 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  35.94 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  29.12 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  28.42 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.85 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  30.6 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  27.83 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.19 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  31.35 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  28 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  28.25 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.76 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>