More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0352 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
323 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  63.27 
 
 
324 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  47.6 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  47.28 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  46.84 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  46.96 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  46.96 
 
 
317 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  46.96 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  46.65 
 
 
317 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  46.65 
 
 
317 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  46.65 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4043  stage V sporulation protein AE  46.18 
 
 
247 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.63 
 
 
334 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
334 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 
344 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
324 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
324 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.36 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 
368 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 
321 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.54 
 
 
324 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
346 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.5 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  27.85 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25.39 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 
351 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
354 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  24.92 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  24.11 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  26.93 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  25.89 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  25.87 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4044  lactamase B  47.14 
 
 
98 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  25.38 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.76 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  26.1 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.01 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.14 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  24.69 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  24.86 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  28.11 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  24.38 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  24.85 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.11 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.61 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  24.1 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  26.65 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  24.48 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  25.94 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  25.17 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 
862 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  34.38 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  24.21 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  24.13 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  26.24 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.85 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  23.01 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
400 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  23.63 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  23.63 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  23.63 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>