More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0562 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  57.19 
 
 		 294 aa  345  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  36.12 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  34.24 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  33.85 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  35.25 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  33.85 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  33.85 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  33.85 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  36.51 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  28.72 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  35.15 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  26.21 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  29.6 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  30.7 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.61 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.05 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  31.33 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 230 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  31.58 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.56 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  29.1 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  31.15 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  29.1 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25.17 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  41.38 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.78 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1026  metallo-beta-lactamase family protein  30.83 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.53 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.37 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  31.39 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  31.86 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  29.71 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  32.64 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  29.71 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  34.74 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  27.97 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  41.11 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  38.3 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  22.96 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  27.08 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>