272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2710 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
237 aa  458  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.83 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 
246 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  35.87 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 
242 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 
214 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
246 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 
247 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
258 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  32.7 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  27.4 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  27.15 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.24 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  29.72 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.96 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  25.71 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  28.44 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.23 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  23.56 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  23.67 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  34.53 
 
 
363 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
334 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  26.27 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  22.71 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 
334 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
282 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  31.72 
 
 
334 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.92 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  23.26 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
321 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
337 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
368 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  33.5 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
329 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
322 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  34.57 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 
298 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  31.74 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.77 
 
 
348 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  31.89 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
402 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
340 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  21.72 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>