More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2203 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
252 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  38.71 
 
 
232 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  45.62 
 
 
226 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  37.12 
 
 
263 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.48 
 
 
255 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
231 aa  85.5  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.89 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  29.85 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  29.85 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  29.85 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  29.85 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  29.85 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  30.73 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  28.5 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  23.26 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  28.28 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  27.98 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
337 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1310  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 
193 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  25.22 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
245 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.84 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.81 
 
 
209 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.44 
 
 
334 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
286 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 
217 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.44 
 
 
213 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.48 
 
 
211 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 
210 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  32.14 
 
 
192 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
294 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
334 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  29.09 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
334 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  31.18 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
209 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  29.02 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  26.26 
 
 
208 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  26.26 
 
 
208 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  30.11 
 
 
431 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
346 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
328 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  28.34 
 
 
242 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 
242 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 
242 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  24.74 
 
 
207 aa  52  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 
339 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
200 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>