More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5069 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
214 aa  410  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  47.96 
 
 
243 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
231 aa  109  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
231 aa  108  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 
242 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
273 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  32.49 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  31.47 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  31.98 
 
 
217 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
287 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  31.98 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  37 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  30.46 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  30.46 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  30.46 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  30.46 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.7 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  30.46 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  23.77 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  23.77 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  23.77 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.84 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  35.53 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  24.55 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.18 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.45 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  24.11 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  23.66 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
402 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  29.95 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.42 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.9 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
321 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.85 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  23.66 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  30.87 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  29.19 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.4 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  22.32 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
574 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  28.91 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.23 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.1 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  29.19 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.15 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  35.12 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.07 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  27.67 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>