254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3408 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  45.38 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  40.07 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  34.12 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  34.12 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  33.78 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  33.45 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  33.78 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  36.4 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  31.79 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  33.45 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  32.95 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  37.34 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  31.44 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  31.16 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.99 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 240 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.48 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  27.67 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.64 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.04 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  30.94 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.45 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  26.48 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.58 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  28.29 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 205 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  32.03 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0123  beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.998731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.01 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  32.81 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  32.81 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  32.03 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  30.72 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3533  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 616 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.14 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  32.74 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.32 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  31.33 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.06 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.05 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>