More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1277 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  45.06 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  42.8 
 
 		 272 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  44.35 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  47.79 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  47.79 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  47.79 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  43.78 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.39 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  27.03 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  32.39 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25.11 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  33.64 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 287 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.03 
 
 		 329 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 294 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.13 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  23.44 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  30.89 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  22.97 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  22.49 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  22.54 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2896  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2327  beta-lactamase-like protein  35.53 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000211578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  28.69 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  21.53 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0232  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20260  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  39.47 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.27 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 308 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3388  beta-lactamase domain protein  43.86 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.07 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.83 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  22.82 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  32.74 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.81 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2313  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00657637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  26.87 
 
 		 335 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  23.58 
 
 		 317 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  23.58 
 
 		 317 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 		 317 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0441  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.43 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.68 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 		 307 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  23.14 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  57.45 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  33.13 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  23.14 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>