280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1024 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  41.72 
 
 
306 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  40.4 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
310 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 
266 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 
267 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
264 aa  122  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  32.74 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
296 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 
302 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.95 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
322 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
312 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
308 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 
307 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
297 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  29.44 
 
 
331 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31 
 
 
312 aa  99  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  28.46 
 
 
337 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
308 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  29.88 
 
 
318 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  29.36 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  23.55 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  27.5 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  28.18 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  25.45 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  25.45 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  25.76 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.44 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  34.25 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
213 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  25 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  32.45 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  32.45 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
335 aa  59.3  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  34.25 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  27.11 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  33.56 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.21 
 
 
214 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 
209 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
252 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  24.28 
 
 
207 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
204 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
226 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
242 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 
214 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  41.79 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  41.79 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>