270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1748 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2193  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1534  hypothetical protein  29.11 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0584627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  29.65 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  26.98 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  29.41 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.91 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  32.19 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.91 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.91 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.91 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.91 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.05 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.14 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  27.96 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  27.49 
 
 		 550 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  31.69 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 484 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  29.55 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  25.85 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 192 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  28.72 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  28.67 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 556 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  25.51 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.65 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  32.58 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.54 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  34.34 
 
 		 500 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.54 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.34 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  26.38 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  25.25 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 544 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 497 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  28.07 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 497 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 322 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  26.91 
 
 		 562 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>