More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1047 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  84.98 
 
 
295 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  74.07 
 
 
299 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  73.4 
 
 
299 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  72.73 
 
 
299 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  71.72 
 
 
300 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  63.27 
 
 
296 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  53.22 
 
 
294 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  58.08 
 
 
277 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  51.56 
 
 
285 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  51.56 
 
 
281 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  50.78 
 
 
285 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  51.17 
 
 
285 aa  288  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  50.39 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  50 
 
 
285 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  50.78 
 
 
281 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
285 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  54.86 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  49.81 
 
 
281 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  51.15 
 
 
322 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  51.47 
 
 
321 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  50.79 
 
 
322 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  46.33 
 
 
275 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  45.42 
 
 
273 aa  214  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  43.2 
 
 
300 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  28.9 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  29.44 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  28.97 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  28.97 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  28.97 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  28.16 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  28.97 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  29.58 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  27.67 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.05 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  29.33 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.2 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  30.33 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  30.24 
 
 
240 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 
226 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  29.05 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.8 
 
 
209 aa  65.1  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
209 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
209 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
209 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
207 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
207 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
210 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  33.14 
 
 
204 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
228 aa  62.4  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
212 aa  62.4  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
215 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.45 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  24.53 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
213 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>