273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2193 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2193  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
279 aa  584  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1534  hypothetical protein  37.02 
 
 
263 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0584627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
271 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 
234 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  24.88 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 
211 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
312 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
400 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.15 
 
 
213 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
214 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  24.1 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  20.51 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  26.04 
 
 
309 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
213 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 
497 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
497 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
307 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.23 
 
 
278 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
310 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  25.54 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  25.54 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  33.03 
 
 
500 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  22.98 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
213 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
242 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 
221 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.28 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
484 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  26.11 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
310 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
281 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 
324 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 
226 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  25.56 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
220 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
206 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
253 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  20.09 
 
 
310 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  23.23 
 
 
365 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  24.74 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  22.35 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  23.56 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1676  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2696  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3172  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  22.06 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  26.9 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2178  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0850031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2617  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1451  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  22.5 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 
299 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  22.99 
 
 
321 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1908  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.952512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  25.45 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3139  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.904093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2563  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>