191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1534 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1534  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0584627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2193  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  26.19 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  28.39 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.53 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 		 497 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 		 497 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 		 307 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  27.6 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  26.21 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  31.25 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  31.79 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  23.94 
 
 		 500 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.58 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  28.37 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  32.35 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 484 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.35 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  30.88 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  30.66 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.89 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  25.53 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  22.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.5 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  24.55 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 344 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.11 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  22.12 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 369 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  24.56 
 
 		 354 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  28.93 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  23.12 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  20.96 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>