More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4704 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
325 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  42.42 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 
323 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
323 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 
322 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 
862 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
328 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
310 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 
339 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
332 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.4 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
368 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
324 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
324 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.25 
 
 
352 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
331 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
321 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
337 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.54 
 
 
354 aa  125  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
321 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
354 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
366 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
322 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  31.35 
 
 
335 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.92 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.41 
 
 
363 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
320 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  29.31 
 
 
353 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.1 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
324 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  28.11 
 
 
341 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
359 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
359 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  28.49 
 
 
359 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
314 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  25.6 
 
 
342 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  26.71 
 
 
366 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
346 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 
359 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
335 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
365 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  29.5 
 
 
357 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  25 
 
 
354 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  27.83 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  26.13 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.53 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  24.92 
 
 
371 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
348 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  25.75 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 
358 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 
359 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  24.85 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 
357 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  29.64 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.38 
 
 
354 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  23.37 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  24.15 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  26.96 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  23.87 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
384 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 
307 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  25.22 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  23.65 
 
 
394 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
383 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  24.93 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  26.33 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  25.63 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  23.86 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.5 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  25.32 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.79 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>