283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0871 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  70.72 
 
 
267 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  65.02 
 
 
266 aa  383  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  67.82 
 
 
266 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
308 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  34.14 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
312 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
307 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
308 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  37.31 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
322 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
306 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  31.85 
 
 
309 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
296 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 
337 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 
310 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
304 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 
302 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 
306 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  32.48 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 
308 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
307 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 
321 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
308 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 
323 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.92 
 
 
316 aa  89.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 
323 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  29.84 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  31.78 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  29.84 
 
 
326 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  30.7 
 
 
326 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  31.78 
 
 
323 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.8 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  33.52 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  31.46 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  32.63 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  38.85 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  30.96 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  26.95 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  28.39 
 
 
566 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
325 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  27.92 
 
 
310 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
335 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
324 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
317 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
302 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  26.27 
 
 
335 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2193  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30 
 
 
348 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  27.84 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
253 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  34.48 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
324 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  27.55 
 
 
566 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  26.42 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.8 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  32.31 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  26.87 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  28.73 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
568 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>