More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1958 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  34.9 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  37.72 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.43 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.32 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.82 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  36.32 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  35.5 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  35.5 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.03 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.31 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  34.51 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  32.49 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.9 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  32.29 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.56 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  31.86 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.48 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  34.83 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  33 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.84 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  29.38 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.65 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  35.39 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  33.55 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  32 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.9 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  35.26 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  33.02 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>