More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1560 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  94.15 
 
 
205 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  91.22 
 
 
205 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  67.32 
 
 
204 aa  290  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  61.35 
 
 
207 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 
209 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  38.92 
 
 
211 aa  99  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
208 aa  94.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.22 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.54 
 
 
207 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.9 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  34.97 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 
251 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  33.16 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  34 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.46 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.43 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  29.3 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.57 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  30.98 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  34.83 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.38 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.38 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  35.23 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  33.52 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0522  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.8 
 
 
232 aa  79  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  30.32 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  30.1 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  28.8 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.85 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  33.82 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  28 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  32.95 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  30.53 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.98 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  29.47 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.71 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>