181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1506 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
320 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  55.73 
 
 
330 aa  345  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  52.22 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  48.86 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.16 
 
 
316 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  49.84 
 
 
328 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  49.67 
 
 
310 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  47.19 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  46.42 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.45 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  47.9 
 
 
361 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  49.53 
 
 
318 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  48.75 
 
 
318 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  48.75 
 
 
318 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  41.79 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  42.46 
 
 
318 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 
321 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  34.31 
 
 
323 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  34.11 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  33.99 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  34.64 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  34.11 
 
 
326 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  34.11 
 
 
323 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  34.11 
 
 
326 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  34.11 
 
 
323 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  41.15 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
319 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  37.91 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  30.42 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  33.44 
 
 
337 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  33.2 
 
 
309 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 
308 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
308 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
307 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
308 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
312 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
310 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
305 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  32.22 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
302 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
306 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
307 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
298 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
266 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  28.03 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.37 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  26.43 
 
 
239 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.47 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
214 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
399 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  21.12 
 
 
245 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 
207 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
204 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 
396 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  22.02 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.03 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
862 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.66 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  31.39 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  24.54 
 
 
404 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.53 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
205 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 
208 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
210 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>