231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
329 aa  671    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  29.26 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.02 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.57 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  20.97 
 
 
292 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
214 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  29.17 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  26.61 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  29.05 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  26.42 
 
 
265 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  27.67 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.1 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  27.7 
 
 
212 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
205 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
214 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  27.39 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
263 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
297 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  28.24 
 
 
215 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
215 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  24.62 
 
 
331 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
318 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 
294 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  28.32 
 
 
308 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 
306 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  28.24 
 
 
215 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 
300 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.07 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
305 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  27.39 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
221 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 
307 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.41 
 
 
207 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  22.42 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.49 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
198 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
216 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
218 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
215 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  30.77 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
215 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  24.8 
 
 
230 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  29.41 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  28.49 
 
 
215 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.95 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
208 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
308 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  27.42 
 
 
293 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
211 aa  49.3  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 
213 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  27.97 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
214 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  26.46 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  31.86 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
214 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  27.03 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  29.86 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  24.42 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  27.15 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>