160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4398 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  100 
 
 		 301 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  92.36 
 
 		 301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  32.66 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  32.66 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  32.66 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.4 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.38 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  25.24 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  28 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.15 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  29.26 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  25 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 		 591 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  24.46 
 
 		 574 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.6 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.88 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  24.87 
 
 		 589 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.95 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.39 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  23.38 
 
 		 592 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.41 
 
 		 582 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  26.26 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  21.72 
 
 		 575 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  25.3 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.73 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.62 
 
 		 575 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.62 
 
 		 575 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.03 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  28.72 
 
 		 566 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.76 
 
 		 574 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  22.06 
 
 		 576 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.9 
 
 		 211 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  29.03 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  26.74 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  23.5 
 
 		 591 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  23.75 
 
 		 352 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  23.96 
 
 		 591 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  23.04 
 
 		 591 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  24.42 
 
 		 591 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  20.87 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06141  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 		 591 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  26.37 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1889  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.49 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.5 
 
 		 530 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.5 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.86 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.22 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.47 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  39.51 
 
 		 563 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  26.05 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  25.32 
 
 		 638 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.54 
 
 		 229 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>