138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3524 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
370 aa  756    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  54.79 
 
 
344 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
371 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  34.82 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  33.79 
 
 
508 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 
263 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 
255 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
259 aa  96.7  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 
254 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
253 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
253 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  29.25 
 
 
246 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
243 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  24.88 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.05 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  28.96 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  28.83 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  26.81 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 
263 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  27.19 
 
 
257 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  27.12 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  27.39 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 
271 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  23.43 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  22.57 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  26.11 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.37 
 
 
878 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  24.58 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.79 
 
 
878 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 
402 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.85 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  31.03 
 
 
291 aa  56.6  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 
397 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  25.23 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.19 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.5 
 
 
569 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  25.93 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.17 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  23.87 
 
 
884 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  22.73 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  22.38 
 
 
401 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 
395 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  24.5 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  23 
 
 
570 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.1 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 
405 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  24.24 
 
 
407 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.4 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
402 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  22.08 
 
 
407 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  24.69 
 
 
257 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  22.98 
 
 
508 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  26.04 
 
 
407 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  23.02 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.92 
 
 
418 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 
574 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  20.48 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 
400 aa  49.7  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  21.39 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.12 
 
 
601 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  22.93 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  24.12 
 
 
591 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  29.63 
 
 
571 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.24 
 
 
576 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  24.35 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  22.94 
 
 
591 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>