135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2200 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  28.24 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  32 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  23.77 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  27.92 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  23.9 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.42 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  34.69 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  28.16 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.16 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  34.12 
 
 		 565 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 340 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  32.98 
 
 		 564 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.6 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  22.48 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 361 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  23.35 
 
 		 862 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  27.49 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  26.42 
 
 		 393 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 559 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  24.84 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  30.49 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 561 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  29.37 
 
 		 574 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25.71 
 
 		 878 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25 
 
 		 878 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 561 aa  46.2  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.74 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 561 aa  45.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  21.74 
 
 		 323 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.54 
 
 		 363 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 404 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 580 aa  45.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  23.08 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  28.89 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 561 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  23.12 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  30.38 
 
 		 561 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 561 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.38 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  23.23 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.17 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  25.65 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.42 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 561 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  22.38 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.17 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.93 
 
 		 616 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  25.45 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.12 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0950  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 619 aa  43.9  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  41.07 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  30.91 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 563 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>