215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  100 
 
 
301 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  92.36 
 
 
301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  30.36 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  30.36 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  30.36 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.66 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  27.97 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  25.37 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
361 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  27.32 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  28.95 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.65 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  28 
 
 
571 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
215 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  24.89 
 
 
574 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.08 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  27.37 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 
591 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  26.97 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
370 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.03 
 
 
582 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  23.38 
 
 
592 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
214 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.77 
 
 
574 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.88 
 
 
352 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  20.19 
 
 
213 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  24.39 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.79 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  24.37 
 
 
589 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  24.84 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1889  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.25 
 
 
264 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  22.95 
 
 
591 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  22.22 
 
 
575 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06141  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  26.25 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 
591 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  24.18 
 
 
591 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  22.06 
 
 
576 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
312 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3157  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 
205 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
253 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  23.04 
 
 
591 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.46 
 
 
354 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  22.54 
 
 
591 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.1 
 
 
575 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  25 
 
 
582 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  23.77 
 
 
582 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.3 
 
 
211 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.03 
 
 
525 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.1 
 
 
575 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.52 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.61 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.41 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.14 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.78 
 
 
354 aa  49.7  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  27.91 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  24.79 
 
 
352 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
212 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  28.21 
 
 
566 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  22.41 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  20.53 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  25.67 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  21.65 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  24 
 
 
575 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25.9 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>