146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1494 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.19 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.3 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  29.77 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.16 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.84 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  29.86 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  26.54 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  26.54 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  26.54 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  29.86 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.56 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  25.11 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.96 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  28.45 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  26.89 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  25.7 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  26.21 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  26.54 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.83 
 
 		 884 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.26 
 
 		 576 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  22.22 
 
 		 508 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.79 
 
 		 576 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  20.19 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  23.01 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  29.71 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  22.62 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  26.51 
 
 		 566 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  22.06 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 		 396 aa  49.3  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.19 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  25.47 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  21.2 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  28.92 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  23.3 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  24.42 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  21.7 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  19.53 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.09 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 		 213 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  31.01 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.06 
 
 		 582 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 205 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  23.41 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  26.39 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  26.99 
 
 		 566 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  26.1 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.11 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>