253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5095 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  82.94 
 
 
293 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
246 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  25.11 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.41 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.49 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  27.57 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  31.58 
 
 
477 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.9 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  24.56 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.21 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  24.45 
 
 
680 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
214 aa  55.8  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  30.72 
 
 
314 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
319 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
319 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  29.41 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.82 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 
591 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  28.43 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  24.78 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.82 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.22 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 
444 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  25.26 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  21.94 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  22.05 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
441 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
319 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.96 
 
 
342 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  32.28 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  25.15 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  29.56 
 
 
304 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 
701 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.81 
 
 
242 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
310 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  29.81 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  29.56 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  25.12 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.65 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  28.05 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.7 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.96 
 
 
319 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 
264 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  26.29 
 
 
1290 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  23.96 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>