180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6079 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 477 aa  984    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  38.07 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  38.56 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  28.42 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 591 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 595 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25.06 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  25.45 
 
 		 621 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 654 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  25.64 
 
 		 654 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 609 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 652 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  24.21 
 
 		 662 aa  94  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  22.7 
 
 		 648 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  24.59 
 
 		 657 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 655 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  23.17 
 
 		 648 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  24.94 
 
 		 653 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.22 
 
 		 661 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 		 687 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.22 
 
 		 661 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  22.9 
 
 		 673 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  24.68 
 
 		 653 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 659 aa  90.1  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  23.54 
 
 		 653 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  23.24 
 
 		 662 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 		 662 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  22.28 
 
 		 661 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  22.28 
 
 		 661 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  22.22 
 
 		 661 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 657 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  22.34 
 
 		 657 aa  87  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  22.28 
 
 		 661 aa  87  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  22.02 
 
 		 661 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 677 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  22.02 
 
 		 661 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  23.12 
 
 		 658 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  22.94 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  21.02 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  23.12 
 
 		 658 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  22.14 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  22.82 
 
 		 701 aa  84.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  21.81 
 
 		 680 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.06 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  21.68 
 
 		 670 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  24.69 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  23.22 
 
 		 675 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.54 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  32.5 
 
 		 645 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 		 631 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  22.17 
 
 		 1290 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  22.48 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 673 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  20.88 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  21.69 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 704 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  20.65 
 
 		 655 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  20.05 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  21.21 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  21.21 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 704 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  28.12 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  22.59 
 
 		 669 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  23.38 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  20.73 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  25.93 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  21.76 
 
 		 629 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  23.34 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  20.62 
 
 		 659 aa  70.1  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 		 658 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  22.25 
 
 		 654 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 		 625 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  20.67 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  21.48 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  20.6 
 
 		 660 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  25.12 
 
 		 625 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 625 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  19.4 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 625 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  21.76 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.77 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>