126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1061 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  100 
 
 		 294 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  40.8 
 
 		 309 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.75 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  27.37 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.04 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  23.12 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  35.21 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  21.34 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  26.48 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  30.63 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  27.17 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  24.41 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  25.2 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  24.5 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  27.88 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.09 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  21.47 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  23.53 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  21.74 
 
 		 444 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  21.63 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.76 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  22.43 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  22.94 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  28.41 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.65 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.65 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.65 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.65 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.65 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01826  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00340)  29.31 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.28 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  23.2 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  23 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  22.99 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  24.38 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.1 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  26.6 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  21.94 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  24.74 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.62 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  32.91 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  26.07 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 209 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  21.32 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.09 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  20.89 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  26.15 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>