More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2018 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  52.56 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  27.7 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.33 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.78 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.28 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  27.7 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  30.54 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  26.9 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  31.91 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  24.88 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.62 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 568 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25.95 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.84 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  24.59 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  27.92 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  24.63 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.19 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.28 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  23.13 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  25.61 
 
 		 562 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.13 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  28.66 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  23.13 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  24.5 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  23.23 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  26.04 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.64 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  25 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.88 
 
 		 248 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.61 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>