268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2888 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  49.65 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  30.74 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  28.67 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 306 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  32.51 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  32.02 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  30.69 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.29 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.24 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.83 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  28.65 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.67 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  29.45 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  29.79 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  25.99 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  25.17 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  30 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  25.96 
 
 		 562 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  21.89 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 		 422 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 198 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  31.1 
 
 		 212 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  27.45 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  25.23 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 557 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.28 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  25.33 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  29.85 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.09 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  28.92 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.36 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 568 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  26.02 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.79 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  31.15 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>