More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  98.76 
 
 
242 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  87.08 
 
 
243 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  79.17 
 
 
241 aa  410  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  59.83 
 
 
247 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  45.53 
 
 
255 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  27.93 
 
 
261 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.54 
 
 
347 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
298 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  29.25 
 
 
311 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
279 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.22 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30.33 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.47 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.66 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  34.04 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  25.32 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
330 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.92 
 
 
323 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.91 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  42.42 
 
 
363 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  23.6 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
334 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  28.77 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  28.83 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.36 
 
 
352 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.31 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.64 
 
 
292 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
213 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  26.84 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  21.95 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
321 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.63 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  22.35 
 
 
218 aa  58.9  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.03 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.8 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  29.19 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  21.79 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  23.75 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.17 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  25.75 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  21.79 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>