More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1067 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  40.8 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.72 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.48 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.62 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  23.83 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  29.75 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  26.04 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  27.13 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.65 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  25.95 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  23.61 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  28.65 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  30.97 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  22.85 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 198 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  20.38 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  23.32 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  23.32 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  25.12 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  24.63 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  31.53 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  26.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  20.63 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  26.99 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.48 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  27.49 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 574 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 		 281 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  33.71 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  26.38 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25.47 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  31.91 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  28.41 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  27.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  32.22 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>