159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1480 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  42.27 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  28.24 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  23.77 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  27.31 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  25.64 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  23.71 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  23.71 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  23.71 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  20.97 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  24.64 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  23.83 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.84 
 
 		 884 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  25.38 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  21.2 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  25.45 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  28.71 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  26.99 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  23.05 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.26 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.24 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  26.55 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  22.96 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  20 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  21.16 
 
 		 397 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  21.96 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.41 
 
 		 393 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  25.6 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  22.99 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  19.82 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.7 
 
 		 394 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 200 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  24.72 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 862 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.3 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  23.49 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  29.13 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  23.03 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  19.7 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  26.17 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.16 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.22 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  29.91 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  20.52 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 217 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  22.32 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 		 407 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  24.88 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  25.64 
 
 		 191 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 221 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 		 210 aa  46.2  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  40 
 
 		 362 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  22.09 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  25.39 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>