More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2620 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  44.05 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  33.61 
 
 
311 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
255 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  33.5 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  33.5 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  31.02 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  29.44 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.9 
 
 
347 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.76 
 
 
303 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0778  beta-lactamase domain-containing protein  45.16 
 
 
97 aa  99  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
298 aa  89  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
243 aa  85.5  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.5 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.71 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.94 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  28.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  28.07 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  28.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  28.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  28.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  25 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.19 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  26.73 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  23.2 
 
 
328 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 
328 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
438 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
337 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
366 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.75 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  37.5 
 
 
348 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 
208 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
214 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 
307 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  25.7 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  26.47 
 
 
566 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  25.87 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 
192 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
323 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.87 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  30.97 
 
 
309 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 
327 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
198 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 
192 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  23.2 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
307 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 
212 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>