More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1485 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  88.07 
 
 
243 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  62.7 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
298 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  32.27 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.63 
 
 
303 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  32.39 
 
 
311 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  33.73 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.71 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  27.16 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  28.23 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  28.28 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  35.68 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.14 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  32.61 
 
 
329 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
310 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
310 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.83 
 
 
347 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
374 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  24.23 
 
 
314 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
317 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
310 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  30.81 
 
 
322 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
302 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
287 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.47 
 
 
209 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
303 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  29.69 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.82 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 
323 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
304 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
205 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
294 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  25.69 
 
 
210 aa  55.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  29.37 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 
376 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.91 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  26.2 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 
197 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.41 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0412  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.08 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1765  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
350 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30.99 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 
862 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 
574 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>