67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3638 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 
299 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  44.53 
 
 
314 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  39.1 
 
 
325 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  36.95 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  35.82 
 
 
322 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
214 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  26.44 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.25 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  27.57 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.04 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  37.31 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.42 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  23.99 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  52.38 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  38.57 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  27.94 
 
 
217 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  24.73 
 
 
241 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 
205 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.7 
 
 
228 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.8 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.35 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  26.52 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.47 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  31.43 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  30.28 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  26.61 
 
 
212 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  26.61 
 
 
214 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  27.74 
 
 
214 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  29.31 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  28.1 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.49 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.49 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.49 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.49 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
208 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.49 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
212 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 
215 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>