61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1122 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 322 aa  675    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  46.95 
 
 		 322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  40.75 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  40.25 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.55 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  34.52 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 253 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  30.41 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.73 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.73 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.53 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  37.18 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  27.32 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  28.95 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  24 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  27.59 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  27.22 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.2 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  22.92 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.56 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 226 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  51.06 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  24.85 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  25 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 210 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.98 
 
 		 259 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 185 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 209 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 214 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  26.61 
 
 		 224 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  28.46 
 
 		 217 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 352 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>