82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1837 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 
286 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  44.81 
 
 
314 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  42.08 
 
 
325 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  35.64 
 
 
322 aa  188  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  34.43 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  27 
 
 
261 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.21 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  22.9 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  28.14 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.06 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.06 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.85 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 
256 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  28.48 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  27.32 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  21.43 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  27.32 
 
 
242 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
210 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.38 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.36 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  29.36 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
215 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.51 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.91 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 
215 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  30.6 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.8 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.55 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
212 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  21.76 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  25.95 
 
 
255 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.22 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.25 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  32.67 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.03 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.49 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.67 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.68 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  23.73 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.23 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
483 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.34 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  29.57 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  27.27 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.21 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.03 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
207 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.09 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.06 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
207 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.03 
 
 
242 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>