More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1663 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  61 
 
 
272 aa  304  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.78 
 
 
254 aa  254  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.34 
 
 
246 aa  254  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  49.61 
 
 
256 aa  252  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
256 aa  245  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.17 
 
 
242 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.7 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.36 
 
 
255 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  52.91 
 
 
255 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.44 
 
 
278 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 
256 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.35 
 
 
260 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  46.5 
 
 
256 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  50 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  40.7 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  44.27 
 
 
255 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.24 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.33 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  49.06 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.87 
 
 
255 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.21 
 
 
248 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  44.83 
 
 
259 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
256 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.85 
 
 
255 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.11 
 
 
256 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.95 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  45.58 
 
 
255 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.27 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.81 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.61 
 
 
256 aa  197  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.44 
 
 
256 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
259 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
259 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.53 
 
 
259 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
259 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.08 
 
 
257 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.53 
 
 
259 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 
248 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.2 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.19 
 
 
258 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.65 
 
 
255 aa  188  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.69 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.43 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.81 
 
 
259 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  44.25 
 
 
227 aa  184  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  42.79 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  41.63 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.36 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.39 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.76 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.69 
 
 
257 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.37 
 
 
257 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.37 
 
 
257 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
254 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.89 
 
 
257 aa  181  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.76 
 
 
259 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.72 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  38.52 
 
 
257 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.62 
 
 
258 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.36 
 
 
257 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
255 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.59 
 
 
282 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.12 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.25 
 
 
259 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.53 
 
 
257 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.98 
 
 
264 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.3 
 
 
257 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06231  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  35.86 
 
 
246 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  41.7 
 
 
255 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  43.1 
 
 
265 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.51 
 
 
256 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.75 
 
 
255 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
255 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.44 
 
 
266 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  35.44 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  45.49 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.21 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  43.7 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.38 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05621  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  37.96 
 
 
253 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.44 
 
 
243 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  40 
 
 
263 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.67 
 
 
259 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 
252 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.84 
 
 
252 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
256 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  34.6 
 
 
303 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.35 
 
 
263 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.12 
 
 
258 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.84 
 
 
259 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.02 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.58 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.78 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.12 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.98 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.65 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>