More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2947 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 309 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  42.62 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  43.29 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  46.75 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  43.92 
 
 		 297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  43.34 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  40.32 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  43.49 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  37.24 
 
 		 331 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  36.78 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  35.95 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.19 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  35.09 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  33.56 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  33.33 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  31.72 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.48 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  33.2 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  35.93 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 267 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  37.66 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  31.34 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  31.11 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  32.67 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.47 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  26.22 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>