62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1235 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
246 aa  85.5  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.94 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4173  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0717561  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.96 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  30.57 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  23.6 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  23.22 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  23.22 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  26.04 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  24.63 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4732  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 
293 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  22.31 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  27.45 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  26.4 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 
271 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2456  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
559 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.04 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  20.55 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.19 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  21.9 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 
342 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  25.93 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.48 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  21.36 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.1 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  22.27 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  19.92 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  24.04 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 
264 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 
323 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>