80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4732 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4732  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
301 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
332 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.69 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  30.69 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  33.14 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.24 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
246 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.69 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.56 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.22 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  28.65 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  28.68 
 
 
244 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.1 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 
591 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  21.81 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  27.5 
 
 
311 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  23.35 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.33 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.43 
 
 
323 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.81 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
320 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25.53 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  26.71 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  26.71 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  26.75 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.54 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.64 
 
 
329 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 
271 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 
317 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.21 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>