122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1371 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  35.81 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  30.9 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  34.2 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  33.78 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3154  Beta-lactamase  34.31 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0822  Beta-lactamase  33.03 
 
 		 269 aa  138  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  32.52 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  34.04 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6144  Beta-lactamase  36.7 
 
 		 278 aa  128  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  32.85 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  27.78 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0380  Beta-lactamase  33.16 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  32.52 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  32.52 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  32.52 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  32.52 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0371  Beta-lactamase  33.68 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.941543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  34.66 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  28.97 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  29.88 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  26.12 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3155  beta-lactamase II  35.66 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0949519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1802  beta-lactamase 2  35.42 
 
 		 158 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  28.83 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.21 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.39 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  29.69 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.21 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.44 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.21 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 339 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.18 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.18 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.69 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  28.21 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.7 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 329 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  22.32 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 321 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  22.37 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 319 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4732  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  25.36 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  25.36 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  24.64 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  24.64 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  21.94 
 
 		 298 aa  48.9  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 305 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  21.33 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.76 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  25.32 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  21.29 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 		 312 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>