95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3485 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  36.29 
 
 
249 aa  185  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  36.07 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  36.59 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  36.1 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  36.59 
 
 
256 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  36.02 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  36.1 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  36.1 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  37.06 
 
 
257 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0822  Beta-lactamase  33.94 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  33.48 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  31.47 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  30 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  35.05 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  31.9 
 
 
272 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3154  Beta-lactamase  33.18 
 
 
237 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  27.98 
 
 
258 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0380  Beta-lactamase  29.58 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1802  beta-lactamase 2  42.36 
 
 
158 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0371  Beta-lactamase  26.8 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.941543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3155  beta-lactamase II  41.13 
 
 
171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0949519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  26.67 
 
 
246 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6144  Beta-lactamase  26.98 
 
 
278 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  28.83 
 
 
244 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  23.11 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.61 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 
318 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 
300 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.29 
 
 
287 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
318 aa  58.5  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  22.55 
 
 
332 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  22.68 
 
 
332 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  21.74 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  20.1 
 
 
318 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 
246 aa  52  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  20.55 
 
 
330 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
323 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  20.7 
 
 
335 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  20.7 
 
 
335 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  20.33 
 
 
319 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  22.18 
 
 
316 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  20.98 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  21.5 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  20.18 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  21 
 
 
319 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 
317 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  21.5 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 
319 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  21.1 
 
 
316 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 
321 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  21.3 
 
 
319 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  20.59 
 
 
319 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  20.59 
 
 
319 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  19.82 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  20.59 
 
 
339 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  20.44 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  23.01 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  20.1 
 
 
319 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  19.51 
 
 
317 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  20.83 
 
 
312 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  20.1 
 
 
339 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  24.27 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  20.44 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  20.44 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  21.94 
 
 
438 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.61 
 
 
337 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  20.44 
 
 
336 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  20.23 
 
 
323 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  20.6 
 
 
318 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  19.55 
 
 
317 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  21.6 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  20.59 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  23.36 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.4 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  22.59 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  22.41 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.24 
 
 
299 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  22.28 
 
 
320 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  19.27 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
479 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  18.97 
 
 
297 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
322 aa  42  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>